Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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