Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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