Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms