Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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GPM6BQ13491 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms