Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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MKRN4PQ13434 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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MKRN4PQ13434 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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MKRN4PQ13434 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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MKRN4PQ13434 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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MKRN4PQ13434 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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