Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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