Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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ITGB3BPQ13352 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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ITGB3BPQ13352 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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ITGB3BPQ13352 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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ITGB3BPQ13352 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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ITGB3BPQ13352 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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ITGB3BPQ13352 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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ITGB3BPQ13352 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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