Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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