Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms