Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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