Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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NME3Q13232 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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NME3Q13232 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
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NME3Q13232 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME3Q13232 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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