Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms