Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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DNAJC3Q13217 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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DNAJC3Q13217 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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DNAJC3Q13217 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC3Q13217 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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DNAJC3Q13217 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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DNAJC3Q13217 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC3Q13217 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC3Q13217 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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DNAJC3Q13217 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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DNAJC3Q13217 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC3Q13217 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC3Q13217 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC3Q13217 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC3Q13217 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC3Q13217 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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