Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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