Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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