Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTP4A2Q12974 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTP4A2Q12974 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTP4A2Q12974 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTP4A2Q12974 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTP4A2Q12974 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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PTP4A2Q12974 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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