Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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