Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
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