Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms