Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms