Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD47Q08722 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms