Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS3BPQ08380 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms