Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FMODQ06828 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FMODQ06828 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FMODQ06828 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FMODQ06828 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FMODQ06828 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FMODQ06828 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FMODQ06828 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FMODQ06828 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FMODQ06828 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FMODQ06828 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FMODQ06828 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms