Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms