Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRB1P82279 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRB1P82279 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRB1P82279 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRB1P82279 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRB1P82279 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRB1P82279 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRB1P82279 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRB1P82279 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB1P82279 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB1P82279 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB1P82279 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB1P82279 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB1P82279 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB1P82279 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB1P82279 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB1P82279 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB1P82279 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms