Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFI35P80217 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFI35P80217 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFI35P80217 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFI35P80217 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms