Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms