Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNRPD3P62318 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms