Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME5P56597 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME5P56597 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms