Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms