Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52P55327 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52P55327 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52P55327 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52P55327 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52P55327 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52P55327 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52P55327 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52P55327 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52P55327 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52P55327 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52P55327 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52P55327 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52P55327 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52P55327 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52P55327 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52P55327 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52P55327 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms