Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF6P49848 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF6P49848 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TAF6P49848 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TAF6P49848 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF6P49848 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF6P49848 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms