Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPIAP49247 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
RPIAP49247 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPIAP49247 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPIAP49247 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPIAP49247 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPIAP49247 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPIAP49247 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPIAP49247 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPIAP49247 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPIAP49247 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPIAP49247 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPIAP49247 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms