Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms