Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC4A3P48751 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms