Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NESP48681 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NESP48681 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NESP48681 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NESP48681 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NESP48681 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NESP48681 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NESP48681 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NESP48681 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NESP48681 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NESP48681 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NESP48681 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NESP48681 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NESP48681 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NESP48681 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NESP48681 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NESP48681 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NESP48681 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NESP48681 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NESP48681 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NESP48681 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NESP48681 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NESP48681 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NESP48681 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NESP48681 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NESP48681 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NESP48681 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NESP48681 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NESP48681 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NESP48681 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NESP48681 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NESP48681 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NESP48681 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NESP48681 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NESP48681 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NESP48681 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NESP48681 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NESP48681 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NESP48681 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NESP48681 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NESP48681 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NESP48681 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NESP48681 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NESP48681 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NESP48681 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NESP48681 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NESP48681 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms