Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IQGAP1P46940 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms