Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRXP46100 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRXP46100 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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