Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCCP43146 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCCP43146 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCCP43146 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCCP43146 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCCP43146 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCCP43146 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCCP43146 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCCP43146 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCCP43146 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCCP43146 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DCCP43146 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DCCP43146 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCCP43146 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCCP43146 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCCP43146 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCCP43146 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCCP43146 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCCP43146 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCCP43146 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DCCP43146 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
DCCP43146 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DCCP43146 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DCCP43146 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DCCP43146 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCCP43146 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCCP43146 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCCP43146 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCCP43146 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCCP43146 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCCP43146 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms