Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms