Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPC1P35052 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms