Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG3P32926 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
DSG3P32926 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms