Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms