Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms