Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMLP26374 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMLP26374 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMLP26374 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMLP26374 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHMLP26374 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMLP26374 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMLP26374 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMLP26374 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CHMLP26374 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHMLP26374 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms