Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTX3P26022 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTX3P26022 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTX3P26022 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTX3P26022 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTX3P26022 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTX3P26022 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTX3P26022 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTX3P26022 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTX3P26022 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTX3P26022 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms