Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APCP25054 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms