Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF3P18847 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF3P18847 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF3P18847 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF3P18847 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF3P18847 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF3P18847 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF3P18847 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF3P18847 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF3P18847 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF3P18847 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF3P18847 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF3P18847 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF3P18847 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.4 ms