Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR1P18146 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR1P18146 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EGR1P18146 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EGR1P18146 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EGR1P18146 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EGR1P18146 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EGR1P18146 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EGR1P18146 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms