Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms